Действие New Genesis происходит через тысячу лет после событий оригинальной игры.

Игроки попадут в совершенно новый открытый мир со сменой времени дня и времён года.

А для его исследования персонажей обучат новым приёмам: фотонный рывок и фотонное скольжение.

Одновременно с выходом New Genesis выпустят графическое обновление для Phantasy Star Online 2.

И игроки смогут использовать в обеих играх одних и тех же персонажей и некоторую экипировку — разумеется, их при переносе подвергнут правкам.

Перемещать между вселенными также позволят премиальную валюту.